首先消毒容器，滚水煮10分钟冷却备用，或者用喷酒精，待酒精完全挥发后使用。 菌液起种： 将砂糖溶解于水中，加入洋葱，盖上盖子或保鲜膜，静置于26℃左右的室温下。 每天敞开盖子摇晃一次，混入氧气，加速酵母菌繁殖。
大概3天左右会开始散发酸味，之后越来越浓烈，大概7、8天制作完成，完成后的菌液有浓烈的酸葱气味，菌液呈粉红色、完全没有浮沫，非常清透干净。 洋葱酵母在整个制作中都没有明显的气泡产生，通过观察液体颜色的变化，以及气味来判断。
菌液制作完成后，可以直接用来制作面包，也可以起种老面。 洋葱老面的起种方法： 50g高筋面粉混合60g菌液，静置24小时；取制作完成的50g前种，混合50g高筋面粉和60g菌液，静置24小时；取制作完成的50g前种，混合50g高筋面粉和50g水，静置24小时：取100g前种，混合100g高筋面粉和100g水，静置24小时，完成，可用于制作面包。 非常推荐直接使用菌液制作面包，面团的葱香非常明显。
制作完成的洋葱菌液冷藏保存，可以保存两三个月，隔两周拿出来喂一次，方法是：加点砂糖摇晃几下，在室温下静置24小时，使酵母菌完全活跃，再放进冰箱冷藏。